Emacsには、変更可能な設定が数多くあります。ほとんどの設定はカスタマイズ可能な変数（変数を参照）であり、これらはユーザーオプションとも呼ばれます。Emacsの動作の多岐にわたる側面を制御するカスタマイズ可能な変数は膨大な数に及び、本マニュアルで解説されている変数は変数索引に一覧されています。また、別の種類の設定としてフェイスがあり、これはテキストのフォントや色、その他の属性を決定します（テキストフェイスを参照）。
設定（変数とフェイスの両方）を閲覧・変更するには、M-x customize と入力してください。これによりカスタマイズバッファが作成され、論理的に整理された設定リストを辿って値を編集・設定し、恒久的に保存できるようになります。