場合によっては、Emacsにパスワードを入力する必要があることがあります。例えば、FTPなどのネットワークプロトコルを介して別のマシン上のファイルにアクセスするようEmacsに指示する場合、そのマシンにアクセスするためにパスワードの入力を求められることがよくあります（リモートファイルを参照）。
パスワードの入力は、ミニバッファの使用に似ています。Emacsはエコーエリアにプロンプト（‘Password: ’など）を表示します。必要なパスワードを入力した後、RETを押して送信してください。他人にパスワードを見られないよう、入力した各文字は通常の形式ではなく、アスタリスク（‘*’）として表示されます。
ミニバッファに関連する機能やコマンドの多くは、パスワード入力時には使用できません。履歴や補完は利用できず、パスワードを送信するまで、ウィンドウの切り替えやその他の操作をEmacsで行うことはできません。
パスワードを入力している最中に、DEL を押すと後方に削除され、最後に入力した文字が取り除かれます。C-u は、これまでに入力した内容をすべて削除します。C-g はパスワードプロンプトを終了します（終了と中断を参照）。C-y は、現在のキル文字をパスワードに挿入します（キルとテキストの移動を参照）。TAB は、パスワードの表示/非表示を切り替えます。パスワードを確定するには、RET または ESC のいずれかを入力します。その他の自己挿入文字キーを押すと、対応する文字がパスワードに挿入され、それ以外の入力はすべて無視されます。
モードラインには、パスワードの表示・非表示を示すアイコンもあります。mouse-1をクリックすると、同様にパスワードの表示・非表示が切り替わります。